在曲靖市，如果你的同事小三有外遇了，你可能会感到震惊、愤怒和失望。然而，处理这种情况的最佳方式可能不是直接与他们发生冲突或离开他们。相反，你应该采取一些措施来保护你的同事和你的工作环境。
首先，你应该与你的同事沟通。这可能很难，但是直接告诉他们你的感受可能会使他们感到尴尬或不舒服。你可以以一种温和、理性和尊重的方式表达你的担忧，并询问他们是否需要帮助来解决这个问题。如果他们愿意回答你的问题，你可以告诉他们你需要一些时间来处理这个问题，并且需要确保你的同事和整个团队仍然保持和谐。
其次，你可以向公司的人力资源部门寻求帮助。如果公司有员工手册或类似的文件，你可能需要阅读并遵守其中的规定。在这种情况下，你可以向人力资源部门咨询，并请求他们提供帮助和指导。
最后，你也可以考虑向当地的婚姻咨询机构寻求帮助。这些机构通常提供专业的婚姻咨询和指导，可以帮助你的同事解决他们的问题，同时保护你自己和整个团队的利益。
总结起来，处理这种情况的最佳方式可能是以尊重和理性的方式开始。与你的同事沟通，寻求公司的帮助，并寻求专业的婚姻咨询机构的帮助。无论你选择哪种方式，都应该确保你的行动是合法和道德的，并尽可能保护你和你的同事的利益。